Príbeh o vzniku a histórii Reiki rozprávali Majstri svojim žiakom stáročia. Traduje sa v tomto podaní:
Dr. Mikao Usui, kresťanský pastor prednášal na univerzite v Kjóto o biblii. V deň keď rozprával žiakom o tom, ako Ježiš konal zázraky uzdravenia, liečil prikladaním rúk, poprosil jeden zo žiakov učiteľa o vysvetlenie toho, akým spôsobom vykonával Ježiš tieto uzdravenia. Usui nevedel odpovedať na túto otázku. Chápal bibliu intelektuálne, ale ako Ježiš liečil nevedel.
Od toho dňa sa všetko zmenilo. Jeho učiteľská česť mu nedovolila pokračovať vo vyučovaní dovtedy, kým nenájde odpoveď na túto otázku. Na základe študentovej zvedavosti sa i on začal zamýšľať nad tým, či by bolo možné naučiť sa tomu úžasnému majstrovskému liečeniu.
Takto sa začal Mikaova Reiki – do. Cesta, ktorá ho z Japonska viedla do Ameriky, kde sedem rokov podrobnejšie študoval bibliu a stal sa doktorom teológie. Ale odpoveď, ktorú hľadal nenašiel. Rozhodol sa vrátiť do Japonska. Ale ani doma neustal v hľadaní. Začal sa zaujímať o Buddhu. Vychádzal z toho, že Buddha uskutočnil rovnaké zázraky ako Ježiš.
Mikao začal merať druhú etapu cesty za objavením zabudnutého tajomstva liečiť. Navštevoval rôzne budhistické sekty a pýtal sa mníchov, či sú schopní vykonávať podobné zázraky ako Buddha. I napriek tomu, že mnísi nevedeli odpovedať nestrácal nádej. Zameral svoje kroky do kláštora zen-budhistov pri Tokiu. A práve tu sa iskrička nádeje rozžiarila. Počas rozhovoru s najvyšším duchovným sa dozvedel, že mnísi poznali tajomstvo uzdravenia, ktoré však upadlo do zabudnutia. Usui požiadal o prijatie do kláštora. Pod vedením svojho predstaveného študoval a zoznamoval sa s posvätnými sútrami, spismi a učením Buddhu. Odpoveď i napriek usilovnému hľadaniu nenachádzal. Rozhodol sa spolu s učiteľom meditovať nad ďalším postupom, a práve vtedy bolo poodhalené rúško tajomstva. Počas meditácie dostal vnuknutie navštíviť posvätnú horu Kurijama neďaleko Kjóto. Usui vykonal púť z Tokia na Kurijamu. Na vrcholku hory sa celý čas postil a meditoval. Keď už dvadsiaty prvý deň prosil o osvietenie, jeho prosby boli vypočuté a stali sa skutočnosťou. V diaľke zažiarilo svetlo, rozpínalo sa ako pestrofarebná dúha a zaplavovalo Kurijamu i Mikaa. Uprostred záplavy Božieho žiarenia sa zobrazovali znaky, ktoré sprevádzal hlas:
,, Tu je kľúč k liečbe. Nauč sa tieto znaky, zapamätaj si ich a nepripusti aby boli zabudnuté.,,
Precitol plný nových síl a nadšenie porozprávať svojmu učiteľovi a každému koho stretne o tom, čo prežil. Ako sa ponáhľal , narazil si pri chôdzi nohu. Priložil si ruky na krvavú ranu a vtedy bolesť i krvácanie prestali. Mikao si svoju schopnosť liečiť a uzdravovať overil i na mladej Japonke, ktorá s opuchom na tvári a bolesťou zubu obsluhovala pútnikov v hostinci.
Po návrate do Tokia zašiel Usui do kráľovstva žobrákov a požiadal o dovolenie liečiť chudobných chorých. Pracoval sedem rokov, liečil od rána do noci a mnohých uzdravil. Až raz stretol jedného z prvých liečených žobrákov.
,, Vyliečil som ťa a pritom si stále žobrákom, ako to ?“
,, Áno . Vstúpil som do spoločnosti, oženil som sa , našiel som si prácu, ale bolo to ťažké. Rozhodol som sa že radšej budem žobrákom. Takto nemusím zodpovedať ani sám za seba.,,
Večer sa Usui zbalil a opustil kráľovstvo žobrákov. Vrátil sa do kláštora, kde mu zverili základný poznatok o liečení ducha a zodpovednosti pacienta v liečebnom procese. Naučil sa piatim duchovným zásadám Reiki, ktoré veľmi ovplyvnili jeho ďalšiu liečiteľskú aktivitu.
Zistil, že keď doteraz nepožadoval od pacienta , aby prevzal za seba zodpovednosť, nedochádzalo pri poskytovaní pomoci k výmene energie. A pochopil, že ak bude sám žiť podľa zjavných duchovných zásad, zmení sa tým nielen jeho život, ale i spôsob liečby chorých. Samotná zmena jeho duchovného života ovplyvní kvalitu jeho energetického poľa, a tým i liečbu.